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针对狗狗巴贝斯焦虫病，治疗方面建议给狗狗使用抗寄生虫的药物，帮助狗狗驱虫巴贝斯虫，需要使用含有三氮脒成分的药物，2-3倍注射用水稀释之后，皮下或者肌肉注射，每天一次，连续2-3天使用。如果狗狗有发烧的症状，建议给狗狗打退烧针。如果狗狗贫血，还需要输血治疗。
去除犬巴贝斯虫病可以使用口服药物和输液治疗，建议给狗狗使用含有盐酸多西环素成分的口服药物。如果狗狗出现了肝功能异常甚至有黄疸的症状，还需要进行输液治疗，促进黄疸快速代谢。由于巴贝斯虫的感染会导致红细胞膜大量裂解，所以如果狗狗出现严重的溶血性贫血，还要考虑进行输血治疗。
对于判断狗狗到底有没有感染犬巴贝斯虫，一般常规检查是带狗狗去宠物医院进行血涂片检查，通过显微镜看里面能不能看到有虫卵。第二种就是比较准确的，带狗狗采集血液之后送到专门的实验室进行检查确诊。一般犬巴贝斯虫症状会出现很快，伴随尿血、呕吐、不吃不喝以及牙龈苍白虚弱等情况。
