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首先需要对症给予一些消炎、抗病毒、止吐、止血、止泻的药物治疗。其次针对病毒可以给予一些特异性的生物制剂，比如干扰素、犬细小病毒单克隆抗体、犬细小病毒高免血清等药物治疗。最后还需要对症给予输液，补充肠外营养，缓解电解质流失，纠正脱水症状。
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通常是不可自愈的，除非是一些成年大型狗才有自愈的可能。在动物医学上是没有狗翻肠子这种说法，民间所说的翻肠子，在兽医学上就是胃肠炎，是非常常见的一种疾病，发病的原因却是多样化的。在4个月以内的幼年狗，导致胃肠炎最常见的病因是细小病毒、冠状病毒、犬瘟热病毒的感染。
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如果只是普通的肠胃炎，可以采取控制饮食，增加肠道益生菌的饮食方法来改善腹泻的情况。如果是病毒性肠炎，需要带狗狗去确诊哪一种病毒感染导致的腹泻，再进行相应的对症治疗。如果是肠道损伤，同样可以带狗狗去医院确定患病面积，再进行处理。
